Le coût de fabrication, c’est-à-dire le coût des composants et du travail, de la version basique de l’iPhone 5 (avec 16 Go de mémoire) est estimé à 207 US$, soit 19 $ de plus que le modèle iPhone 4S correspondant. Le dispositif pour la 4G LTE coûte à lui seul 34 $, soit 10 $ de plus que le dispositif cellulaire de l’iPhone 4S. De même, l’écran coûte 44 $, soit 7 $ de plus que son prédécesseur. Mashable note que les marges dégagées par Apple sont « énormes », le prix de vente à l’unité étant généralement de 649 $10.
Comme évoqué plus haut, le manque de stock devient évident après l’annonce de la sortie du téléphone, principalement en raison d’un manque de certains composants comme les écrans ; d’après les premiers rapports, la société Sharp, un des trois sous-traitants pour l’écran tactile, aurait été incapable de produire et livrer à temps pour la sortie, à la différence de Japan Display et LG Display11, tandis que d’autres sous-traitants avancent des difficultés à soutenir la demande. Ces incertitudes entraînent une forte hausse des précommandes, si bien que la date de livraison des précommandes est repoussée après la date initiale de sortie du téléphone